Канонические церкви подразделяются на два вида: автокефальные и автономные церкви. Такие церкви имеет собственное самоуправление, отличие же состоит в том, что предстоятели автономных церквей утверждаются управляющим органом матери-церкви.
Такие церкви существуют в полном каноническом согласии с другими церквами при отсутствии явного письменного соглашения, какие из церквей признавать автономными, а какие автокефальными. Однако, есть церкви, канонический статус которых был признаны не всеми независимыми церквами, в частности, большинство из дочерних к РПЦ церквей не были признаны некоторыми древними церквами. У всех церквей существует так называемый список поминовения, в который заносятся предстоятели признанных ею церквей.
Автокефальные церкви
— Вселенский Константинопольский патриархат
— Александрийский патриархат
— Антиохийский патриархат
— Иерусалимский патриархат
— Московский патриархат
— Сербский патриархат
— Румынский патриархат
— Болгарский патриархат
— Грузинский патриархат
— Кипрская православная церковь
— Элладская (Греческая) православная церковь
— Польская православная церковь
— Албанская православная церковь
— Чехословацкая православная церковь
— Православная церковь Америки (автокефалия признали только РПЦ, БПЦ, ГПЦ, ППЦ, ЧПЦ)
Автономные церкви
— Синайская православная церковь ИП
— Финская православная церковь КП
— Эстонская православная церковь КП (автономию признала только КПЦ)
— Японская православная церковь МП (автономию признала только РПЦ)
— Китайская православная церковь МП (автономию признала только РПЦ)
— Украинская православная церковь МП (автономию признала только РПЦ)
— Охридская архиепископия СП (автономию признала только СПЦ)
Сии церкви ранее были либо автокефальными, либо автономными, но в настоящее время исчезли или стали неправославными.
— Карфагенская церковь
— Латвийская церковь
— Литовская церковь
— Римская церковь
Следующие церкви непризнанны основными церквами в качестве независимых или канонических.
— Украинская православная церковь Киевского патриархата
— Белорусская православная автокефальная церковь
— Македонская православная церковь
— Черногорская православная церковь
— Украинская автокефальная православная церковь
Следует заметить, что в диптихах РПЦ и других дочерних церквей, ранжир четырёх, следующих за Московским патриархом, церквей отличается. За московский патриархом следует грузинский, затем сербский, румынский и, наконец, болгарский.